一、江苏省家禽科学研究所升为“国家级”（论文文献综述）
唐修君,樊艳凤,贾晓旭,葛庆联,陆俊贤,唐梦君,韩威,高玉时[1]（2021）在《基于线粒体DNA D-loop区的肉鸡品种遗传多样性和起源分析》文中研究表明【目的】探讨不同生长速度鸡品种（配套系）线粒体DNA D-loop区全序列遗传多样性和起源特性,为肉鸡品种选育和溯源提供理论依据。【方法】以不同生长速度的8个黄羽肉鸡配套系（中快速型5个、慢速型3个）、2个地方鸡种（固始鸡、藏鸡）、2个引进鸡种（隐性白羽鸡、安卡鸡）、1个白羽肉鸡（罗斯308）、817杂交肉鸡以及1个高产蛋鸡配套系（大午褐壳蛋鸡）共计15个鸡种为研究对象,采集血液提取DNA后进行PCR扩增,对15个鸡种共683个个体mtDNA D-loop区全序列进行测序,使用DnaSP 5.10软件分析各个鸡种遗传多样性和单倍型特点,使用MEGA 4.0软件计算种间遗传距离,构建不同单倍型与红色原鸡之间NJ系统发育树,分析起源和亲缘关系。【结果】15个鸡种线粒体D-loop区全序列大小为1 231—1 232bp,序列长度为1 231 bp的个体在859 bp处存在C碱基缺失。683个个体共检测到45个变异位点,组合为53个单倍型,可以分为A、B、C和E共4个单倍型群,其中中快速型肉鸡、817杂交肉鸡以及高产蛋鸡均是E单倍型为优势单倍型（≥48.89%）;慢速型黄羽肉鸡中鸿光黑鸡优势单倍型为B单倍型,京海黄鸡优势单倍型为A单倍型,雪山鸡4种单倍型相对均衡,3个慢速型黄羽肉鸡配套系E单倍型比例≤38.46%;地方鸡种中固始鸡的单倍型为A和C型,藏鸡的单倍型为A和B型。15个鸡种单倍型多样度（Hd）分布在0.496—0.853,核苷酸多样度（Pi）分布在0.00146—0.00673,遗传多样性相对丰富的品种（配套系）是新兴矮脚黄鸡、雪山鸡、京海黄鸡和罗斯308;遗传多样性程度相对较低的品种（配套系）是藏鸡、高产蛋鸡、安卡鸡、新兴麻鸡4号和墟岗黄鸡1号。15个鸡种Kiumura双参数距离范围为0.0016—0.0113,其中罗斯308种内遗传距离最大,而817杂交肉鸡和高产蛋鸡的种内遗传距离最小;种间遗传距离最大为高产蛋鸡与藏鸡之间,最小为高产蛋鸡与817杂交肉鸡之间;中快速型黄羽肉鸡配套系相互之间遗传距离相对较小,而与慢速型黄羽肉鸡配套系以及地方鸡种之间遗传距离相对较大;京海黄鸡和鸿光黑鸡均是与藏鸡遗传距离最小。聚类分析显示,A、B单倍型群与红色原鸡滇南亚种交叉聚为一枝;E单倍型与红色原鸡印度亚种交叉聚为一枝;C单倍型群与红色原鸡印度亚种、滇南亚种、指名亚种以及印尼亚种交叉聚为一枝。【结论】不同生长速度鸡种之间线粒体D-loop区遗传多样性程度差异较大;E单倍型与肉鸡生长速度具有较强的相关性,中快速型群体均以E单倍型为优势单倍型,而慢速型群体E单倍型比例均低于40%;我国家鸡群体具有多个红色原鸡母系起源,显示其在中性选择下被驯化。研究结果为肉鸡品种选育和溯源以及资源化开发利用提供了理论依据。
郝子悦,张琴,周成浩,张会永,殷建玫,薛倩,李国辉[2]（2021）在《五个地方鸡种蛋品质的比较研究》文中研究指明为探讨藏鸡、茶花鸡、北京油鸡、狼山鸡和汶上芦花鸡5个地方鸡种的蛋品质差异,挖掘地方鸡种蛋用性能,研究对5个地方鸡种的蛋品质性状进行方差分析及相关性分析。结果显示:汶上芦花鸡的平均蛋重显着高于藏鸡和茶花鸡（P≤0.05）;藏鸡和茶花鸡的蛋壳色泽显着浅于狼山鸡（P≤0.05）,藏鸡的蛋壳强度显着高于狼山鸡（P≤0.05）;汶上芦花鸡的蛋白高度显着高于藏鸡（P≤0.05）;5个品种的蛋黄色泽、蛋形指数、蛋黄比率和哈氏单位之间没有显着性差异（P>0.05）。5个品种的蛋壳强度和蛋壳厚度呈极显着正相关（P≤0.01）,汶上芦花鸡的蛋重和蛋黄色泽呈极显着性正相关（P≤0.01）,藏鸡的蛋重和蛋黄比率呈极显着性负相关（P≤0.01）。此外,5个品种蛋品质性状的平均变异系数都超过12%,证明保种群体内的遗传变异较大,群体近交程度较低,遗传多样性丰富。研究结果表明蛋品质性状在不同品种间存在显着差异且地方品种在蛋品质性状上具有优异的潜在性能,为地方鸡种资源的保护及开发利用提供基础数据参考。
薛倩,李国辉,殷建玫,张会永,周成浩,朱云芬,邢伟杰,苏一军,邹剑敏,韩威[3]（2021）在《鸡繁殖性能近交衰退相关CpG岛差异甲基化基因的筛选》文中研究表明鸡繁殖性能近交衰退是地方鸡遗传资源活体保种过程中面临的重要问题之一,本研究旨在探讨全基因组CpG岛（CpG island, CGI）区DNA甲基化在鸡繁殖性能近交衰退中的作用。分别从狼山鸡高近交组和低近交组中各选取健康母鸡3只,即试验分2个组,每组3个重复,然后采用全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）技术,检测分析两组个体性腺轴组织（包括卵巢和下丘脑）全基因组DNA甲基化差异,筛选差异甲基化区域（DMRs）,并对CpG岛区差异甲基化基因进行功能注释和富集分析。结果表明,狼山鸡高近交组和低近交组比较,其卵巢和下丘脑基因组整体甲基化水平均不存在显着差异（P>0.05）;高、低近交组间差异甲基化区域检测发现,下丘脑和卵巢中分别检测到5 948和4 593个差异甲基化区域,其中1 798和995个差异甲基化区域位于基因组CpG岛区,分别注释到1 020和552个基因;下丘脑中,这些CpG岛区差异甲基化基因显着富集在信号转导、神经系统发育、生殖系统发育和卵母细胞成熟调控等繁殖相关的GO条目,以及转化生长因子β信号通路、乙型肝炎、脂肪酸代谢、胰岛素信号通路等19条KEGG信号通路（P<0.05）;卵巢中,CpG岛区差异甲基化基因显着富集于12条信号通路（P<0.05）,包括慢性骨髓白血病、流感A、精氨酸和脯氨酸代谢、粘着连接等,一些与卵子发育和性激素分泌相关的信号通路也被富集到,如黄体酮介导的卵母细胞成熟、卵母细胞减数分裂、GnRH信号通路、雌激素信号通路等,其中包含CDC27、ADCY8、AKT3等10个差异甲基化基因。因此,本研究在狼山鸡高、低近交组间检测到了大量差异甲基化区域,并发现大量差异甲基化基因与繁殖性状相关,推测这些基因CpG岛区DNA甲基化可能在狼山鸡繁殖性能近交衰退调控中发挥重要作用,研究结果为进一步深入探索鸡繁殖性能近交衰退调控机制奠定了基础,为物种资源保护和家禽育种工作提供了理论参考依据。
巨晓军,章明,屠云洁,刘一帆,单艳菊,姬改革,张笛,邹剑敏,束婧婷[4]（2021）在《基于主成分分析的不同品种鸡肉品质评价》文中指出本研究旨在利用主成分分析法对不同品种鸡的肉品质进行综合评价,为鸡肉品质评价标准的建立提供参考。选用常规方法对隐性白羽肉鸡、安卡鸡、文昌鸡、北京油鸡、清远麻鸡5个不同品种鸡肉的pH、肉色、失水率、剪切力、肌内脂肪、氨基酸、脂肪酸含量等指标进行测定,利用主成分分析法建立不同品种鸡肉品质评价模型,利用该模型对5个品种鸡肉品质进行评价,并通过品尝评价法对模型评价结果进行检验。结果表明,主成分分析提取出4个主成分因子,第1主成分的方差贡献率为72.721%,第2主成分为12.582%,第3主成分为9.106%,第4主成分为5.591%,累积方差贡献率为100%,且特征值均大于1,包含了鸡肉37个指标的大部分信息。利用这4个新的综合指标来替代原来的多个复杂指标进行分析。建立了鸡肉品质综合评价模型,利用模型进行肉品质得分评价的结果是:清远麻鸡>北京油鸡>文昌鸡>隐性白羽肉鸡>安卡鸡,地方品种鸡肉质均优于快大型白羽肉鸡。5个品种鸡肉质的品尝得分排名为:清远麻鸡>北京油鸡>文昌鸡>隐性白羽肉鸡>安卡鸡。由此得出,经由主成分分析,从37项原始指标提取出4个主成分,反映了原所有肉质指标包含的全部信息;清远麻鸡主成分综合得分最高,其次是北京油鸡、文昌鸡,隐性白羽肉鸡、安卡鸡,结果与品尝评价结果一致。基于主成分法对不同品种鸡肉品质进行综合评价是客观的和可行的。
李国辉,曹愉夏,薛倩,张会永,殷建玫,朱云芬,沈海玉,窦新红,苏一军,王克华,邹剑敏,韩威[5]（2021）在《狼山鸡高、低近交组卵巢组织转录组差异分析》文中指出为了探究近交对繁殖效应的影响,本研究以国家级地方鸡种基因库保存的狼山鸡为素材,结合分子标记和系谱信息,组建高、低近交两个试验组,记录高、低近交组的繁殖性能数据。选取高、低近交组中正常个体各3只,采取卵巢组织进行RNA-seq测序,并对差异基因进行功能注释。结果在高、低近交组中共获得差异转录本1 114个,其中783个基因获得注释,307个上调,476个下调。GO和KEGG分析表明,差异基因主要富集在核糖体的生物合成、炎性反应、繁殖、生长、免疫系统过程、代谢过程等生物学过程,Pathway显着富集在叶酸的生物合成、卵母细胞成熟和代谢等生物学通路。功能分析发现,筛选出的差异基因（如GGH、CPEB1、GNMT和PIWIL等）与繁殖功能相关。此外,还包括一些与应激和免疫相关的基因（如APOC3、HSP70、CD38和LGMN等）。研究结果有助于了解狼山鸡繁殖性状近交衰退相关的基因及其调控机制,为家禽特定性状近交衰退分子机理提供参考。
薛倩,李国辉,张会永,殷建玫,周成浩,朱云芬,邢伟杰,苏一军,邹剑敏,韩威[6]（2021）在《狼山鸡下丘脑和卵巢组织全基因组DNA甲基化分析》文中研究指明为了获得狼山鸡性腺轴组织基因组DNA甲基化水平和模式等表观遗传信息,试验采用全基因组重亚硫酸盐测序（whole genome bisulfite sequencing,WGBS）技术检测狼山鸡下丘脑和卵巢组织基因组DNA甲基化状态,分析两组织DNA甲基化水平及特异甲基化模式。结果表明,狼山鸡下丘脑和卵巢基因组整体甲基化水平分别为4.35%和3.48%,差异显着（P<0.05）;下丘脑和卵巢中分别检测到6 150 000和10 320 000个甲基化胞嘧啶（mC）位点,其中mCG类型位点分别占69.99%和87.88%,下丘脑中非mCG位点占比约为卵巢中的2.5倍;与各染色体不同,两组织线粒体基因组中mCHH位点占比最高,其次是mCHG位点;卵巢基因组启动子区DNA甲基化水平极显着低于内含子和外显子区（P<0.01）,极显着高于基因间区（P<0.01）;下丘脑基因组启动子区DNA甲基化水平与内含子和外显子区相比差异不显着（P>0.05）,却显着高于基因间区（P<0.05）;下丘脑基因组各功能元件DNA甲基化水平均显着或极显着高于卵巢基因组（P<0.05;P<0.01）。综上,狼山鸡下丘脑和卵巢组织具有不同的DNA甲基化模式和特征,下丘脑中较高的非mCG位点比例可能在中枢神经系统发育中发挥重要作用,本研究结果为进一步分析鸡卵巢和下丘脑基因组DNA甲基化对其繁殖性能调控机制提供参考依据。
唐修君,贾晓旭,樊艳凤,葛庆联,唐梦君,周倩,陆俊贤,韩威,高玉时[7]（2021）在《基于mtDNA控制区2个地方鸡品种遗传多样性及起源研究》文中认为为探讨我国2个地方蛋鸡品种仙居鸡和白耳黄鸡遗传多样性和起源进化,以30只仙居鸡和30只白耳黄鸡为素材,通过PCR扩增和测序技术,对其进行线粒体DNA控制区全序列单倍型和遗传多样性分析,并结合GenBank公布的19条红色原鸡D-loop区全序列,构建系统发育树。结果表明:2个鸡品种变异区集中在第167—1 215 bp之间,共发现19个多态位点和9个单倍型,其中仙居鸡和白耳黄鸡各有3种特异单倍型。系统发育分析显示,9种单倍型可分为A、B和C共3个分支,白耳黄鸡的优势单倍型属于B分支,仙居鸡的优势单倍型属于C分支。聚类分析显示,白耳黄鸡主要与原鸡滇南亚种聚为一类,仙居鸡与原鸡印度亚种、滇南亚种、指名亚种和印尼亚种聚为一类,具有多个母系起源。这一研究从分子水平为2个蛋用型地方鸡品种仙居鸡和白耳黄鸡遗传资源开发利用和保护提供了理论依据。
刘宏祥,王健,宋卫涛,朱春红,陶志云,徐文娟,章双杰,李慧芳[8]（2021）在《太湖鹅4个群体保种效果的遗传评价》文中研究说明为全面了解太湖鹅品种在江苏省保种效果动态变化过程,并与浙江省太湖鹅的保种情况进行比较,采用简化基因组测序方法对江苏太湖鹅群体（TS、TC、TK）以及浙江太湖鹅群体（TZ）的群体遗传参数进行系统比较分析。结果发现,与前2个世代相比,由于采用了严格的家系等量随机选配法以及适当进行种群间种用个体的相互引进,TC、TK群体近交系数分别下降到0.087 5和0.075 3;遗传结构分析和主成分分析均表明,TZ群体独立于其他3个群体之外,且出现明显分化,TZ群体与TS群体的遗传分化系数(Fst)达到了0.051 5,近交系数为0.110 7,明显高于江苏省太湖鹅群体。TZ群体与TS群体的选择信号分析发现,脂肪酸代谢相关通路的基因受到了选择。以上结果表明,江苏省太湖鹅群体保种效果较好,家系等量随机选配法以及适当血缘交换可以避免近交系数上升。
殷建玫,朱云芬,薛倩,李国辉,张会永,苏一军,韩威[9]（2020）在《基于RAD-seq简化基因组测序的河南斗鸡遗传进化研究》文中进行了进一步梳理研究旨在基因组水平上揭示河南斗鸡的遗传进化机制。利用RAD-seq简化基因组测序鉴定河南斗鸡与其他18个地方鸡种、2个引入肉鸡品种的SNP标记,计算遗传统计量,分析河南斗鸡的遗传多样性和遗传结构,鉴定受选择基因。结果表明,在河南斗鸡中鉴定出SNP标记259,412个。与其他18个地方鸡种相比,河南斗鸡的观察杂合度Ho（0.1560）和核苷酸多样度Pi（0.1752）均为最低,近交系数Fis为0.1099,遗传多样性相对匮乏;河南斗鸡的平均遗传分化系数Fst最高（0.2187）,平均基因流Nm最低（0.9017）,在以引入品种为外群的系统发育树中形成一个独立的分支。通过Fst和θπ检验,在河南斗鸡中鉴定出24个受选择区域、129个受选择基因。GO和KEGG分析表明这些受选择基因主要富集在能量代谢、神经系统发育、运动行为、微管细胞骨架等生物学通路。
韩威,朱云芬,殷建玫,李国辉,薛倩,张会永,沈海玉,苏一军,窦新红,王克华,邹剑敏[10]（2020）在《基于RAD-seq简化基因组测序的19个地方鸡种遗传进化研究》文中进行了进一步梳理旨在基因组水平上揭示地方鸡种的遗传进化,发掘重要种质特性基因。本研究利用简化基因组RAD-seq测序鉴定19个地方鸡种（每个品种按照家系选取30个个体,10公、20母）基因组SNP标记,计算观察杂合度（Ho）、核苷酸多样度（Pi）、近交系数（Fis）、遗传分化系数（Fst）和基因流（Nm）等遗传统计量指标,分析地方鸡种的遗传多样性和遗传结构,并通过选择信号检测鉴定基因组受选择基因。结果表明,在19个地方鸡种中鉴定出400 562个SNPs标记。瓢鸡（PJ）和文昌鸡（WC）的遗传多样性最为丰富,观察杂合度（Ho）分别为0.246 8、0.243 0,核苷酸多样度（Pi）分别为0.278 1、0.265 5;河南斗鸡（DJ）的遗传多样性相对匮乏,Ho为0.156 0,Pi为0.175 2;东乡绿壳蛋鸡（DX）和边鸡（BJ）的近交系数最高（Fis>0.160 0）。瓢鸡与文昌鸡、惠阳胡须鸡（HX）、藏鸡（ZZ）、大围山微型鸡（WX）,惠阳胡须鸡与文昌鸡,藏鸡与茶花鸡（CH）间的遗传分化最低（Fst<0.100 0）,对应的基因流最高（Nm>0.240 0）。河南斗鸡与其它品种间的遗传分化均处于较高水平,与其中15个品种间的Fst>0.200 0、Nm<1.000 0。遗传聚类分析（2个引入品种做外群）将地方鸡种总体上分为5类,与品种形成历史和地理分布基本吻合。通过选择信号分析,在19个地方鸡种合并群体中检测出9个常染色体上的26个区域受到选择作用,包含31个受选择基因。这些受选择基因广泛参与免疫系统调节、生殖机能调控、应激响应、代谢等生物学过程。利用基因组SNP标记能更全面准确地揭示地方鸡种的遗传多样性和遗传结构,选择作用主要体现在对地方鸡种抗逆抗病特性、配子活力及行为等方面的塑造。
二、江苏省家禽科学研究所升为“国家级”（论文开题报告）
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、江苏省家禽科学研究所升为“国家级”（论文提纲范文）
（1）基于线粒体DNA D-loop区的肉鸡品种遗传多样性和起源分析（论文提纲范文）
| 0 引言 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验材料 |
| 1.2 试验方法 |
| 1.2.1 总DNA提取 |
| 1.2.2 引物合成 |
| 1.2.3 PCR扩增和测序 |
| 1.3 数据处理和分析 |
| 2 结果 |
| 2.1 15个鸡种线粒体控制区序列分析 |
| 2.2 15个鸡种线粒体控制区单倍型分析 |
| 2.3 15个鸡种线粒体控制区遗传多样性和遗传距离 |
| 2.4 系统进化树和中介网络图的构建 |
| 3 讨论 |
| 3.1 15个鸡种mt DNA控制区序列结构 |
| 3.2 15个鸡种mt DNA控制区单倍型特征 |
| 3.3 15个鸡种mt DNA控制区遗传多样性 |
| 3.4 15个鸡种系统发生关系和母系起源 |
| 4 结论 |
（2）五个地方鸡种蛋品质的比较研究（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验鸡种 |
| 1.2 检测指标及方法 |
| 1.3 统计与分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 数据正态性和方差齐性检验 |
| 2.2方差分析 |
| 2.3 相关性分析 |
| 3 讨论 |
| 4 结论 |
（3）鸡繁殖性能近交衰退相关CpG岛差异甲基化基因的筛选（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验动物和样品采集 |
| 1.2 DNA提取和WGBS建库测序 |
| 1.3 数据过滤质控和甲基化胞嘧啶(mC)位点识别 |
| 1.4 DMR检测与CpG岛区DMR相关基因功能富集分析 |
| 1.5 亚硫酸氢盐测序PCR(bisulfite sequencing PCR,BSP)方法验证WGBS分析结果 |
| 1.6 数据处理分析 |
| 2 结 果 |
| 2.1 狼山鸡高、低近交组繁殖性能差异 |
| 2.2 WGBS数据概述以及狼山鸡全基因组DNA甲基化水平分析 |
| 2.3 狼山鸡高、低近交组间差异甲基化区域检测 |
| 2.4 下丘脑基因组CpG岛区差异甲基化基因功能注释分析 |
| 2.5 卵巢基因组CpG岛区差异甲基化基因功能注释分析 |
| 2.6 差异甲基化区域BSP验证 |
| 3 讨 论 |
| 4 结 论 |
（4）基于主成分分析的不同品种鸡肉品质评价（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验方法 |
| 1.2 测定方法 |
| 1.2.1 鸡肉品质测定 |
| 1.2.2 氨基酸、脂肪酸 |
| 1.3 主成分分析 |
| 1.4 鸡胸肉品质品尝评价方法 |
| 1.5 数据的统计分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 不同品种鸡肉品质性状的主成分分析 |
| 2.2 不同品种鸡肉质的品尝得分及排名 |
| 3 讨 论 |
| 4 结 论 |
（5）狼山鸡高、低近交组卵巢组织转录组差异分析（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 狼山鸡高低近交组的建立及转录组测序个体的筛选 |
| 1.2 转录组测序方法 |
| 1.3 生物信息学分析 |
| 1.4 实时荧光定量PCR验证 |
| 2 结 果 |
| 2.1 高、低近交组平均分子近交系数的计算及生产性能统计 |
| 2.2 测序数据统计及差异基因的筛选 |
| 2.3 差异表达基因GO功能注释 |
| 2.4 差异表达基因KEGG富集分析 |
| 2.5 差异表达基因实时荧光定量PCR技术验证 |
| 3 讨 论 |
| 4 结 论 |
（6）狼山鸡下丘脑和卵巢组织全基因组DNA甲基化分析（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 样品采集 |
| 1.2 主要试剂及仪器 |
| 1.3 DNA提取和WGBS建库测序 |
| 1.4 数据过滤质控和甲基化胞嘧啶(mC)位点识别 |
| 1.5 甲基化水平计算 |
| 1.6 数据处理方法 |
| 2 结 果 |
| 2.1 WGBS数据产出统计 |
| 2.2 狼山鸡下丘脑和卵巢全基因组DNA甲基化状态 |
| 2.3 下丘脑和卵巢各染色体上DNA甲基化分布特征 |
| 2.4 基因组不同功能元件DNA甲基化水平分析 |
| 3 讨 论 |
| 4 结 论 |
（7）基于mtDNA控制区2个地方鸡品种遗传多样性及起源研究（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验材料 |
| 1.2 引物合成 |
| 1.3 PCR扩增和测序 |
| 1.4 数据处理和分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 2个地方鸡品种mtDNA D-loop区全长序列多态性 |
| 2.2 2个地方鸡品种mtDNA D-loop区单倍型 |
| 2.3 2个地方蛋鸡品种与红色原鸡系统发育分析 |
| 3 讨论 |
| 3.1 2个地方鸡品种mtDNA D-loop区结构特征及遗传多样性 |
| 3.2 2个地方鸡品种母系起源与开发利用 |
| 4 结论 |
（8）太湖鹅4个群体保种效果的遗传评价（论文提纲范文）
| 1 试验方法 |
| 1.1 供试动物 |
| 1.2 试验方法 |
| 1.2.1 ddRAD简化基因组测序 |
| 1.2.2 参考基因组比对与单核苷酸多态性(SNP)检测 |
| 1.3 数据处理 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 太湖鹅4个群体基因组SNP鉴定 |
| 2.2 群体内遗传多样性分析 |
| 2.3 群体间遗传分化分析 |
| 2.4 群体间遗传结构分析 |
| 2.5 群体PCA分析 |
| 2.6 基因流分析 |
| 2.7 选择信号分析 |
| 3 结论与讨论 |
（9）基于RAD-seq简化基因组测序的河南斗鸡遗传进化研究（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验材料 |
| 1.2 试验方法 |
| 1.2.1 RAD-seq 简化基因组测序 |
| 1.2.2 SNP 质控 |
| 1.2.3 统计分析 |
| 2 结 果 |
| 2.1 基因组SNP鉴定 |
| 2.2 群体遗传多样性分析 |
| 2.3 群体遗传结构分析 |
| 2.4 选择信号分析 |
| 3 讨 论 |
| 3.1 基因组SNP鉴定和遗传多样性分析 |
| 3.2 基因组选择信号分析 |
（10）基于RAD-seq简化基因组测序的19个地方鸡种遗传进化研究（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 试验材料 |
| 1.2 试验方法 |
| 1.2.1 RAD-seq 简化基因组测序 |
| 1.2.2 SNP 质控 |
| 1.2.3 统计分析 |
| 2 结 果 |
| 2.1 19个地方鸡种的基因组SNP鉴定 |
| 2.2 19个地方鸡种群体遗传多样性分析 |
| 2.3 19个地方鸡种群体遗传结构分析 |
| 2.4 19个地方鸡种选择信号分析 |
| 3 讨 论 |
| 3.1 地方鸡种基因组SNP鉴定 |
| 3.2 地方鸡种群体的遗传多样性和遗传结构分析 |
| 3.3 地方鸡种的选择信号分析 |
| 4 结 论 |
四、江苏省家禽科学研究所升为“国家级”（论文参考文献）
- [1]基于线粒体DNA D-loop区的肉鸡品种遗传多样性和起源分析[J]. 唐修君,樊艳凤,贾晓旭,葛庆联,陆俊贤,唐梦君,韩威,高玉时. 中国农业科学, 2021
- [2]五个地方鸡种蛋品质的比较研究[J]. 郝子悦,张琴,周成浩,张会永,殷建玫,薛倩,李国辉. 中国家禽, 2021(12)
- [3]鸡繁殖性能近交衰退相关CpG岛差异甲基化基因的筛选[J]. 薛倩,李国辉,殷建玫,张会永,周成浩,朱云芬,邢伟杰,苏一军,邹剑敏,韩威. 畜牧兽医学报, 2021(04)
- [4]基于主成分分析的不同品种鸡肉品质评价[J]. 巨晓军,章明,屠云洁,刘一帆,单艳菊,姬改革,张笛,邹剑敏,束婧婷. 家畜生态学报, 2021(04)
- [5]狼山鸡高、低近交组卵巢组织转录组差异分析[J]. 李国辉,曹愉夏,薛倩,张会永,殷建玫,朱云芬,沈海玉,窦新红,苏一军,王克华,邹剑敏,韩威. 中国畜牧兽医, 2021(03)
- [6]狼山鸡下丘脑和卵巢组织全基因组DNA甲基化分析[J]. 薛倩,李国辉,张会永,殷建玫,周成浩,朱云芬,邢伟杰,苏一军,邹剑敏,韩威. 中国畜牧兽医, 2021(02)
- [7]基于mtDNA控制区2个地方鸡品种遗传多样性及起源研究[J]. 唐修君,贾晓旭,樊艳凤,葛庆联,唐梦君,周倩,陆俊贤,韩威,高玉时. 扬州大学学报(农业与生命科学版), 2021(01)
- [8]太湖鹅4个群体保种效果的遗传评价[J]. 刘宏祥,王健,宋卫涛,朱春红,陶志云,徐文娟,章双杰,李慧芳. 河南农业科学, 2021(01)
- [9]基于RAD-seq简化基因组测序的河南斗鸡遗传进化研究[J]. 殷建玫,朱云芬,薛倩,李国辉,张会永,苏一军,韩威. 家畜生态学报, 2020(05)
- [10]基于RAD-seq简化基因组测序的19个地方鸡种遗传进化研究[J]. 韩威,朱云芬,殷建玫,李国辉,薛倩,张会永,沈海玉,苏一军,窦新红,王克华,邹剑敏. 畜牧兽医学报, 2020(04)